آزمایشگاه مرجع معاونت بهداشـت دانشـگاه علوم پزشـکی ایران به عنوان یکی از عناصر نظام مراقبت با هدف دسترسی شهروندان به خدمات آزمایشگاهی با کیفیت مطلوب و نیز افزایش توان کشور در پاسخگویی به نیازهای سلامت در شش بخش غربالگری نوزادان، بهداشت محیط، ویروس شناسی آب و فاضلاب، بهداشت حرفه ای،  سل، HIV و کووید 19 فعالیت می کند.