این مرکز در سال ۱۳۳۰ جهت استفاده در امور درمانی وقف شد که در ابتدا به عنوان درمانگاه فعالیت داشته و سپس به عنوان بیمارستان تخصصی کودکان فعالیت خود را ادامه داده است.در سالهای قبل از انقلاب بیمارستان شهید فهمیده توسط سازمان شیر خورشید و بعد از انقلاب ابتدا توسط سازمان هلال احمر و سپس بهداری استان تهران اداره می شد. در حال حاضر نیز این مرکز درمانی با تعرفه های دولتی زیر نظر دانشگاه علوم پزشکی ایران فعالیت کرده و تنها مرکز تخصصی کودکان و نوزادان در جنوب تهران است که از شهرستان های جنوب و جنوب غربی استان تهران نیز جهت خدمات دهی به این مرکز مراجعه می کنند.کلینیک فوق تخصص آسم و آلرژی، کلینیک فوق تخصصی نوزادان، کلینیک فوق تخصصی مغز و اعصاب، کلینیک فوق تخصص ریه، کلینیک فوق تخصص گوارش، کلینیک تغذیه، کلینیک روانشناسی بالینی و کلینیک رایگان شیرمادر در بیمارستان شهید فهمیده فعال هستند.